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Une charge de déchets et une charge liquide sont placées dans les chambres de l'autoclave.

Un cycle peut se terminer dans les délais prévus tout en ne stérilisant pas correctement une partie de la charge — pour des raisons physiques opposées selon qu’il s’agit d’un flacon de milieu de culture ou d’un sac de déchets. Voici ce qui se passe réellement à l’intérieur de la chambre dans chaque cas, et comment charger l’autoclave en conséquence.