Kambri uks avatakse ja steriliseeritavad esemed paigutatakse kambri sisse. Käesolevas näites on steriliseeritavad esemed paigutatud Morrisoni jäätmekonteineritesse. Kui aurugeneraatoris on veetase madal, täitub see automaatselt uuesti.

Vaakumpump eemaldab kambrist õhu, luues kambris madalama rõhu ja eemaldades osa steriliseeritavatesse esemetesse kinnijäänud õhust.

Klapp avaneb ja aurugeneraatorist tulev aur täidab kambri, suurendades kambri sisemist rõhku ja eemaldades veelgi rohkem õhku, mis on kambris olevates esemetes kinni jäänud.

Kambri rõhk läbib korduvaid tsükleid, mille käigus kambrit survestatakse auruga, seejärel aga vaakumiga rõhust vabastatakse. See surub kokku ja paisutab kambris kinni jäänud õhku, tõrjudes selle taskutest välja, kuni kogu õhk on asendatud auruga.

Auru generaator jätkab tööd, lisades autoklaavi kambrisse veel auru. Mida rohkem auru lisatakse, seda kõrgemaks tõusevad rõhk ja temperatuur. Kui kambri temperatuur jõuab 121 °C-ni või kõrgemale, algab laadingu steriliseerimine. Temperatuuri hoitakse ettenähtud aja jooksul, et tagada täielik steriliseerimine.

Kui steriliseerimine on lõppenud, suletakse aurugeneraatori ventiil ja kamber jahtub. Temperatuuri ja rõhu langedes kondenseerub aur veeks, mis koguneb kamberi põhja. Kui rõhk on võrdsustunud, juhib ventiil vee välja ja kambri ust saab ohutult avada.