Hazne kapağı açılır ve sterilize edilecek öğeler haznenin içine yerleştirilir. Bu örnekte, sterilize edilecek nesneler Morrison atık kapları içinde bulunmaktadır. Buhar jeneratöründeki su seviyesi düştüğünde, sistem otomatik olarak yeniden doldurulur.

Vakum pompası hazneden havayı çeker, böylece hazne içinde daha düşük bir basınç oluşturur ve sterilizasyon gerektiren nesnelerin içinde hapsolmuş havanın bir kısmını dışarı atar.

Bir valf açılır ve buhar jeneratöründen gelen buhar odayı doldurur; bu sayede odanın içindeki basınç artar ve odadaki nesnelerin içinde hapsolmuş havanın daha fazlası dışarı atılır.

Haznedeki basınç, hazneyi buharla basınçlandırma ve ardından vakumla basınçsızlaştırma döngülerini tekrar tekrar geçirir. Bu işlem, haznede sıkışmış havayı sıkıştırır ve genleştirir, tüm hava buharla değiştirilene kadar havayı ceplerden dışarı atar.

Buhar jeneratörü çalışmaya devam eder ve otoklav odasına daha fazla buhar ekler. Daha fazla buhar eklendikçe, basınç ve sıcaklık artar. Oda 121°C veya daha yüksek bir sıcaklığa ulaştığında, yükün sterilizasyonu başlar. Tam sterilizasyonu sağlamak için sıcaklık önceden belirlenmiş bir süre boyunca korunur.

Sterilizasyon tamamlandığında, buhar jeneratörüne giden vana kapatılır ve hazne soğur. Sıcaklık ve basınç düştükçe, buhar suya dönüşür ve haznenin dibinde birikir. Basınç dengelendiğinde, bir vana suyu boşaltır ve hazne kapağı güvenli bir şekilde açılabilir.